奔四的邵先生

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发表了博文《群体样本PCA作图》你要的群体样本PCA作图我已经帮你写好了,请直接用!!嗯,就是方便,快捷!!rawdata=read.table("final_matrix.pca",header=T°群体样本PCA作图 ​​​​

群体样本PCA作图

你要的群体样本PCA作图我已经帮你写好了,请直接用!!嗯,就是方便,快捷!!rawdata=read.table("final_matrix.pca",header=T)##读取文件,行为基因
发表了博文《教你用ggbarplot画图》说明:本程序主要是在小窗口下能高清显示图片能特意定制的参数,里面涉及的数值可以根据具体项目设置°教你用ggbarplot画图 ​​​​¡查看图片

教你用ggbarplot画图

说明:本程序主要是在小窗口下能高清显示图片能特意定制的参数,里面涉及的数值可以根据具体项目设置
发表了博文《structure画图--不同K的情况下》第一步:格式转换vcftols--vcfsample.vcf--plink--outsampleplink--filesample--chr-se°structure画图--不同K的情况下 ​​​​

structure画图--不同K的情况下

第一步:格式转换vcftols --vcfsample.vcf --plink --out sampleplink --filesample --chr-set 20--noweb --ma
发表了博文《GeneBasedAssociation(GBA)分析》Gene-BasedAssociation(GBA)analysis是基于全基因组关联分析的一种目前GWAS可以分为基于突变(SNP°GeneBasedAssociation(GBA)分析 ​​​​

GeneBasedAssociation(GBA)分析

Gene-Based Association (GBA)analysis是基于全基因组关联分析的一种目前GWAS可以分为基于突变(SNP,CNV,SV),基因和通路三种。其中基于突变的主要是单核苷酸
发表了博文《数据模拟方法》文章摘自:°数据模拟方法 ​​​​

数据模拟方法

文章摘自:https://zhuanlan.zhihu.com/p/87408242https://github.com/stat-lab/EvalSVcallersOption 3: I
发表了博文《ATAC-seq分析》1、背景超敏位点和基因表达有关,并且超敏位点反应了染色质的可及性。也就可以反推出“可及性”的染色质结构区域可能与基因表达调控相关。使用了超敏Tn5转座酶切割染色质的开°ATAC-seq分析 ​​​​

ATAC-seq分析

1、背景超敏位点和基因表达有关,并且超敏位点反应了染色质的可及性。也就可以反推出“可及性”的染色质结构区域可能与基因表达调控相关。使用了超敏Tn5转座酶切割染色质的开放区域,并且加上接头(adapt
发表了博文《突变过滤策略》值得注意的是:Allreadswithamappingquality<70wereremovedpriortocalling.其它策略包括:Basedonouranalysi°突变过滤策略 ​​​​

突变过滤策略

值得注意的是: All reads with a mapping quality &lt; 70 were removedprior to calling.其它策略包括:Based on ou
发表了博文《快速定位fastq的质量体系》邵先生有话说:在工作中难免领导会给你一堆数据,然后让你去分析,很多情况下不清楚是用什么仪器测序的,质量体系是多少,这时候就是抓心挠肺的时候,不用急,以下脚本帮°快速定位fastq的质量体系 ​​​​

快速定位fastq的质量体系

邵先生有话说:在工作中难免领导会给你一堆数据,然后让你去分析,很多情况下不清楚是用什么仪器测序的,质量体系是多少,这时候就是抓心挠肺的时候,不用急,以下脚本帮你解决这个问题(这个脚本我也不清楚哪来的,
发表了博文《Linuxshell之提取文件名和目录名的一些方法总结》转自:O网页链接邵先生有话说:先说说我为什么要转这篇文章,因为在°Linuxshell之提取文件名和目录名的一些方法总结 ​​​​

Linuxshell之提取文件名和目录名的一些方法总结

转自:https://www.jb51.net/article/103875.htm邵先生有话说:先说说我为什么要转这篇文章,因为在之前的工作中每个样本名字都是不一样的,所以不需要特殊处理,而今
发表了博文《2019年03月13日》一直用perl处理数据,今天心血来潮尝试用python写了一个质控程序,因为是第一次写,所以很多地方都没有优化,但总算能完整跑出结果来,mark!!!##fq_qc°python小试牛刀 ​​​​

python小试牛刀

邵先生有话说:一直用perl处理数据,今天心血来潮尝试用python写了一个质控程序,因为是第一次写,所以很多地方都没有优化,但总算能完整跑出结果来,mark!!!##fq_qc.py#! /
发表了博文《肿瘤MSI(笔记)》0.引言微卫星不稳定(MSI),是由于错配修复(MMR)基因突变导致错配修复蛋白表达缺失而引起的,自1993年Altonen等首次在遗传性非息肉病性结直肠癌(HNPCC°肿瘤MSI(笔记) ​​​​¡查看图片

肿瘤MSI(笔记)

0.引言微卫星不稳定(MSI),是由于错配修复(MMR)基因突变导致错配修复蛋白表达缺失而引起的,自1993年Altonen等首次在遗传性非息肉病性结直肠癌(HNPCC)中发现存在高频MSI(MSI
发表了博文《肿瘤TMB》0、引言(O免疫治疗生物标志物之TMB)PD-1是表达于T细胞表面的免疫抑制性受体。PD-1与其配体——主°肿瘤TMB(笔记) ​​​​¡查看图片

肿瘤TMB(笔记)

0、引言(http://fashion.eastday.com/a/181220142622499.html)PD-1是表达于T细胞表面的免疫抑制性受体。PD-1与其配体——主要表达于肿瘤细胞、炎
发表了博文《支持向量机、随机森林、人工神经网络算法》支持向量机、随机森林、人工神经网络这三种算法在平时计算过程中会经常碰到,特别是用于各种项目中的建模,在网上找到了一个例子,觉得挺合适,详细请链接ht°支持向量机、随机森林、人工神经网络算法 ​​​​

支持向量机、随机森林、人工神经网络算法

支持向量机、随机森林、人工神经网络这三种算法在平时计算过程中会经常碰到,特别是用于各种项目中的建模,在网上找到了一个例子,觉得挺合适,详细请链接https://blog.csdn.net/csqazw

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